1996年取得了国家测绘局颁发《甲级测绘资质证书》，2003年通过ISO9001：2000质量管理体系认证，是浙江省测绘学会海洋测绘专业委员会挂靠单位。五十多年来，本院始终从事江、河、海地形测绘、水文测验及海洋综合水文勘测。主要有地形测绘、水文测验、海洋物理探测、泥沙分析等专业。本院除完成国家指令性任务外，积极服务于社会，五十多年来共完成地形测绘面积达33万平方公里，水文测验1263个点位（垂线），采集5000余个潮期的潮流泥沙等资料，为钱塘江整治、杭州湾水土资源开发利用及国家、省市重点工程提供大量水文、泥沙、地形、物探等宝贵资料。

技术力量雄厚，在强潮河口具有十分丰富的勘测经验；专业技术人员分布合理，现有职工70多名，其中高级工程师10名、高级会计师1名、工程师18名、经济师1名，会计师1名，初级技术人员27名、船长3名、轮机长2名、水手5名。

2007年4月，经浙江省机构编制委员会批准：浙江省河口海岸研究所测验队更名为浙江省河海测绘院，为浙江省水利河口研究院所属社会公益性事业单位。机构规格相当于副县处级。

主要职责：从事钱塘江、杭州湾水下地形测绘、水文测验及水下障碍物探测；从事沿海、河流及湖泊水下地形测绘、水文及水下障碍物探测；为浙江省河流、河口、海岸的科学研究，钱塘江杭州湾的规划、防汛减灾和钱塘江河口预报，浙江省海塘建设、江道整治、水土资源的开发和利用等提供服务。

仪器设备先进，除传统的地形测量、水文测验、海洋物理探测、泥沙分析仪器设备外，还拥有双频阿什泰克GPS RTK、天宝双频高精度GPS RTK、GPS信标机、电子水准仪、全站仪、数字式回声测深仪、声速仪、多波速测深系统、侧扫声纳系统、浅地层剖面仪、海洋磁力仪、声学多普勒流速剖面仪、SZF型自动遥报波浪仪、马尔文MS2000激光粒度分析仪等一大批先进专业仪器设备。

2011年，经联评核查和会议审议，获得了由浙江省精神文明建设指导委员会授予的“浙江省文明单位”荣誉称号。