当地降雨径流、河川基流和洪水，经过净化处理的生活污水和工业废水等，凡能满足回灌水质要求的均可作为回灌水源。
用于地下水回灌的水质，一般含重金属及难以降解的有毒物质应不超过生活饮用水水质标准，以防污染地下水。当直接向井中注水回灌时，还要求水质低浊度、低铁、低溶解氧、无细菌和有机物，以及不舍对井管和滤水器有腐蚀作用的物质。
回灌时地表水需经过简易处理，其方法为：将地表水送入大水池，先使小颗粒泥沙沉淀；再送入加药池，加入氯、硫酸铝（10%溶液）、碳酸钠（10%溶液），形成絮凝状物质沉淀于池里；然后经过沙过滤池和净化池；净化后的水即可用于回灌。
