一年生小草本，高5～13厘米。叶全部基生，具极短之柄，卵圆形，卵形至倒卵形，长5～8毫米，顶端圆钝或浑圆，全缘，无毛，叶脉不明显。茎1～3支，无叶，不分枝，或两叉分枝，上部疏生短腺毛。花序为长的疏穗状花序。花小，无梗；苞片卵形，长不及1毫米；花萼筒部（子房）狭长，疏生腺毛，裂片小，前方2枚合生为一个在顶端浅2裂的裂片，长1.8毫米，其余3枚条形，长1.2毫米；花冠白色，长约2毫米，筒部短，前方一枚裂片极小，卵形，反折成唇片，其余4枚向后开展，最后方2枚较长，顶端2裂，基部有附属物；合蕊柱长3.5毫米，伸出；子房2室。蒴果细柱状，长约8毫米。

花柱草属植物共有320种左右,绝大多数为多年生草本植物（部分拥有半木质茎干）。根部都比较发达，生长较为旺盛。少数为一年生通过种子或者地下块茎繁殖。 在众多种类中，花柱草的形态也可谓千变万化。有些没有明显的茎干、以莲座状生长的高度不过1厘米的矮小品种。也有呈松枝状生长的高达2米的亚灌木品种（如Stylidium laricifolium）。花柱草的叶片有像松树叶一样细长的针形叶，也有些叶子比较宽大，如骟马花柱草（Stylidium debile）。叶长从1厘米不到至数十厘米不等，部分平贴地面（如长柱花柱草）或指向空中直立生长。也有一部分围绕着直立的茎干生长，如我国的狭叶花柱草（Stylidium tenellum）。