第十六工程局有限公司始终把工程质量放在首位，形成了一整套科学而严格的工程质量保证体系，于1998年率先在福建省首家通过中国方圆委质量认证中心ISO—9002质量体系认证，并得到有效贯彻。承建的厦门国际机场工程获国家优质工程银奖；福建池潭水电站工程获水电部优质工程奖；福建水口水电站工程获当年全国百万级电站质量评比之首；福建长乐国际机场站坪工程被评为国家民航总局优良工程；福建棉花滩水电站工程获福建省优质工程奖、全国首个整体达标投产的水电工程奖、中国建筑工程鲁班奖；福建西门水电站工程获国家优质工程银奖；福建周宁水电站工程获国家电力工程优质奖；赤道几内亚毕科莫水电站工程获赤道几内亚总统勋章；乌兹别克斯坦塔什干国际机场修复工程获国电公司优秀境外项目奖；广州新白云国际机场荣获全国十大建设科技成就奖；上海浦东国际机场工程荣获上海市政工程金奖和全国市政金杯示范工程奖。
