根据上述职责，区住房保障局内设5个职能科（室）：

（一）办公室

负责全局日常工作的协调；督促检查局长办公会议和局务会议决定的贯彻执行情况；管理全局日常行政后勤事务、节假日值班安排、文秘、档案、信息、办公用品采购、安全保卫、清洁卫生、考勤、考核工作；负责局大型综合性会议的会务及接待工作；负责全局人事、劳资、福利管理等工作，管理局属资产；协助局领导处理日常工作，完成局领导临时交办的工作任务。

（二）计财科

负责全局财务管理工作；负责办理各类票据的审核报销工作；严格执行各种财务登记手续，负责做好支票和票据的保管、领发；严格按照会计法规要求，及时准确做好报帐、记帐、报表报送等工作，及时发现各种问题并提出合理建议；完成局领导临时交办的工作任务。

（三）安居办

负责制定年度安居工程计划并组织实施；负责公租房建设及房源组织；协调城镇居民保障性住房建设；职工货币补贴的申报、审核。

（四）廉租房科

负责廉租房货币补贴和实物配租的审批、发放、配置。

（五）经济适用房科

负责经适房货币补贴的审批、兑现、配置；负责公租房的审批、配置。