根据上述职责，市水利局设13个内设机构：

（一）办公室。

负责文电、会务、机要、档案等机关日常运转工作；承担信息、保密、信访、政务公开、社会治安综合治理、新闻发布及人大、政协建议提案办理工作。

（二）规划计划与财务科。

拟订全市水利发展及战略规划，组织编制全市重大水利综合规划、专业规划和专项规划；审核市管和市重点水利建设项目建议书、可行性研究报告和初步设计；组织实施水工程建设项目合规性审查工作；组织编制市水利部门预算；承担局机关并指导直属单位的财务管理工作；承担全市有关水利资金和国有资产的监督管理及业务统计工作；提出有关水利价格、收费、信贷的建议。

（三）政策法规科。

推进全市水利行业依法行政工作，组织起草有关地方性规范性文件；组织、指导全市水利行政许可工作并监督检查；承办局行政应诉、行政复议和行政赔偿工作；协调跨县（市）区水事纠纷；指导水政监察和水行政执法。

（四）水资源科（襄樊市节约用水办公室）。

组织实施水资源取水许可、水资源有偿使用、水资源论证等制度；组织水资源调查、评价和监测工作；指导、组织水量分配、水功能区划和水资源调度工作并监督实施；组织编制水资源保护规划；指导饮用水水源保护、城市供水的水源规划工作；指导城市污水处理回用等非传统水资源开发的工作；组织指导入河排污口设置工作；组织指导计划用水和节约用水工作。

（五）水库堤防科。

承担全市水库管理工作，组织编制水库运行调度规程并监督实施，组织、指导水库大坝注册登记、大坝安全鉴定和蓄水安全鉴定工作；组织实施水库除险加固并进行监督检查。承担全市主要河流、湖泊及堤防建设与管理工作，负责全市河道堤防行业管理。

（六）水土保持科。

承担全市水土流失综合防治工作；组织编制水土保持规划并监督实施；组织水土流失监测、预报并公告；审核全市开发建设项目水土保持方案并监督实施。

（七）农水农电科。

组织协调全市农田水利基本建设，组织指导农村节水灌溉、排水及雨洪资源利用等工程建设与管理；承担灌区、泵站、机井归口管理工作；指导农村水利社会化服务体系建设。指导、组织水能资源规划编制，组织水电农村电气化和小水电代燃料工作。

（八）农村饮水安全办公室。

负责指导、组织、协调全市农村饮水安全工程规划编制、工程建设实施与管理工作；指导全市乡镇供水工作。

（九）防洪调度科。

组织实施重要江河湖泊和重要水工程防汛抗旱调度和应急水量调度，以及突发洪涝灾害的应急处理；编制全市防汛抗旱应急预案并组织实施；指导、监督重要江河防汛演练和抗洪抢险工作；组织、协调、指导山洪等灾害防御工作、城市防洪工作以及蓄滞洪区安全建设、管理和运用补偿工作，负责洪泛区、蓄滞洪区和防洪保护区的洪水影响评价工作。负责全市洪水水情、农田墒情监测和全市水旱灾情发布；组织、指导农业生产科学抗旱，减少灾害影响。

（十）通讯与信息化科。

负责全市水利工程、防汛抗旱通讯设施建设、管理与维护，指导、组织全市水利信息化建设与管理工作。

（十一）建设科(安全监督科)。

指导、组织水利工程建设管理，组织实施水利工程质量管理；指导、组织水利建设市场的监督管理和信用体系建设;承担全市水利行业安全生产监督工作，指导水库、水电站大坝的安全监管，组织实施水利工程安全监督；组织开展市管水利工程建设项目的稽查工作。

(十二)市南水北调工程建设管理办公室。

负责与南水北调工程建设相关配套工程建设的协调；负责汉江襄樊段水能资源梯级开发的前期和申报工作；负责南水北调工程建设项目技术方案审核上报、建设管理；负责南水北调工程相关的水利项目投资工程的施工、质量监督、运行、维护管理；协助市政府有关部门作好汉江襄樊段水利综合经济开发工作。

(十三)人事科。

负责机关和直属单位的人事管理、机构编制、劳动工资、职工教育培训工作；负责水利体制改革的有关工作；组织实施相关水利科学研究、技术引进和科技推广。

机关党委 负责局机关和直属单位的党群工作,办事机构设在人事科。

纪检监察机构 按有关规定设置。

离退休人员工作科负责局机关离退休干部工作，指导直属单位的离退休干部工作。