PHP最初是1994年Rasmus Lerdorf创建的，刚刚开始只是一个简单的用Perl语言编写的程序，用来统计他自己网站的访问者。后来又用C语言重新编写，包括可以访问数据库。在1995年以Personal HomePageTools (PHP Tools) 开始对外发表第一个版本，Lerdorf写了一些介绍此程序的文档，并且发布了PHP1.0。在这早期的版本中，提供了访客留言本、访客计数器等简单的功能。以后越来越多的网站使用了PHP，并且强烈要求增加一些特性，比如循环语句和数组变量等等，在新的成员加入开发行列之后，在1995年中，PHP2.0发布了。第二版定名为PHP/FI(Form Interpreter)。PHP/FI加入了对MySQL的支持，从此建立了PHP在动态网页开发上的地位。到了1996年底，有15000个网站使用 PHP/FI；时间到了1997年中，使用PHP/FI的网站数字超过五万个。而在1997年中，开始了第三版的开发计划，开发小组加入了 Zeev Suraski 及 Andi Gutmans，而第三版就定名为PHP3。2000年，PHP4.0又问世了，其中增加了许多新的特性。

在2000年5月22日，以Zend Engine 1.0为基础的PHP 4正式释出，2004年7月13日则释出了PHP 5，PHP 5则使用了第二代的Zend Engine[5]。PHP包含了许多新特色，像是强化的面向对象功能、引PDO（PHPData Objects，一个存取数据库的延伸函数库）、以及许多效能上的增强。PHP 4已经不会继续更新，以鼓励用户转移到PHP 5。

2008年PHP 5成为了PHP唯一的有在开发的PHP版本。将来的PHP 5.3将会加入Late static binding和一些其他的功能强化。PHP 6 的开发也正在进行中，主要的改进有移除register_globals、magic quotes 和 Safe mode的功能等。