根据上述职责，宁南县交通运输局设4个内设机构：

办公室。

负责机关日常政务的综合协调工作；负责机关文秘、信息、档案、机要、保密、安全、信访等工作；负责机关人事、机构编制、党风廉政建设、社会治安综合治理、维稳、精神文明、计划生育、爱国卫生等工作；牵头办理人大、政协议案、提案；负责机关涉外工作和会务、财务、基建、车辆管理等后勤服务工作。

工程管理股。

负责拟订全县公路交通网规划及路桥测设、招标、质监、造价和合同管理工作；负责组织实施全县农村公路建设；负责组织协调相关部门对全县道路的养护管理；负责公路工程及公路桥梁的安全管理；负责工程资料的上报、保管等工作。

交通法制股（行政审批服务股）。

承担本系统、本部门推进依法行政工作的组织协调和督促指导；负责交通运输行政执法监督、行政复议和规范性文件审核备案工作；管理交通运输执法证件；负责行业精神文明建设；负责受理和办理州、县人民政府公布的涉及本部门的行政审批事项和公共服务事项。

运输安全股。

参与拟订综合运输发展战略，组织拟订全县公路、水路运输行业发展规划并监督实施；负责公路、水路运输市场监督管理；组织协调重点运输、紧急客货运输；组织拟订公路、水路安全生产、应急管理的相关制度并监督实施；负责交通运输系统应急处置体系建设；依法组织或参与有关事故调查处理工作。

宁南县交通战备办公室。主要职责：拟订本县有关国防交通工作的规定；规划本县国防交通网路布局，对本县交通建设提出有关国防要求的建议；拟订本县国防交通保障计划；负责本县的国防运力动员和运力征用；参与制定和实施本县的国防交通物资储备计划，调用国防交通物资；监督本县国防交通工作，协调处理有关问题；承担上级国防交通主管机构和县人民政府交办的其他事项。核定主任1名（正科级）、副主任1名（副科级）。

宁南县交通运输局机关行政编制7名。核定局长1名、副局长2名；纪检组长1名（副科级）。

机关工勤人员控制数1名。

（一）将原县交通局职责划入县交通运输局。

（二）取消已由州、县政府公布取消的行政审批事项。

（三）取消公路养路费、公路运输管理费、公路客货附加费等交通规费的征收职责。

（四）加强综合运输体系规划的衔接，促进各种运输方式协调发展。

（五）加强统筹区域和城乡交通运输协调发展职责，优先发展干线交通，大力发展农村交通，加快推进区域和城乡交通运输一体化。

（六）加强交通运输行业安全监督管理和交通运输应急管理职责。

（七）加强对交通运输行业和产业项目的招标投标活动的监督。

（一）贯彻执行党和国家有关交通运输行业的方针、政策和法律、法规；组织实施公路、水路行业政策和标准。

（二）根据全县经济发展总体规划，组织拟订全县公路、水路及汽车客、货运输站场等交通运输发展中长期规划和年度计划；负责制定农村公路发展措施并监督实施。

（三）负责本系统、本部门依法行政工作，落实行政执法责任制；指导公路、水路行业有关体制改革工作。

（四）承担公路、水路交通运输市场监督管理责任；培育公路、水路运输市场，维护行业平等竞争秩序；指导城乡客运管理工作。

（五）承担水上交通安全监督管理责任；负责水上交通运输船舶及相关水上设施检验、登记及船员管理相关工作；指导水上交通安全事故及相关水上设施污染事故的应急处置，依法组织或参与事故调查处理工作。

（六）负责提出公路、水路固定资产投资规模和方向、县财政性资金安排建议；会同有关部门拟订公路、水路有关规费政策并监督实施，提出有关财政、土地、价格等政策建议。

（七）承担公路、水路建设市场监督管理责任；贯彻执行公路、水路及汽车站场工程建设相关政策、制度、技术标准，组织公路、水路及汽车站场相关重点工程建设和工程质量、安全生产监督管理工作；负责交通运输基础设施管理和维护，承担有关重要设施的管理和维护。

（八）承担公路、水路行业安全生产和应急管理工作；按规定组织协调重点物资和抢险、救灾、战备等紧急客货运输；组织协调地方交通战备工作，承担国防动员有关工作。

（九）贯彻国家有关交通运输科技政策，指导实施交通运输行业计量、质量、技术标准和规范工作；开展相关统计工作，发布有关信息；指导公路、水路行业环境保护和节能减排工作。

（十）负责公路、水路有关涉外工作，开展对外经济技术交流与合作，指导全县交通运输行业招商引资和利用外资工作。

（十一）承担路政管理职责；监督路政管理部门对公路的路产路权按照法律法规进行维护。

（十二）承担州、县政府公布的有关行政审批事项。

（十三）承办县政府交办的其他事项。

（一）会同有关部门制定运输价格。

（二）原县交通局管理的下属事业单位划归县交通运输局管理。

（三）按凉府发〔2010〕18号文件精神，宁南县公路管理局和宁南县公路运输管理所划归宁南县交通运输局领导和管理。

（四）所属事业单位的设置、职责和编制事项另行规定。

本规定由中共宁南县委机构编制委员会办公室负责解释，其调整由中共宁南县委机构编制委员会办公室按规定程序办理。

本规定由中共宁南县委机构编制委员会办公室负责解释，其调整由中共宁南县委机构编制委员会办公室按规定程序办理

（一）宁南县防汛抗旱指挥部办公室设在水务局。

（二）所属事业单位的设置、职责和编制事项另行规定。

本规定由中共宁南县委机构编制委员会办公室负责解释，其调整由中共宁南县委机构编制委员会办公室按规定程序办理。