白马井站设于西线高速公路西侧、315省道北侧新地村一带，距白马井城镇规划中心约3公里，距洋浦经济开发区约8公里，距西线高速公路约1公里，为本线中间站。车站中心里程K110+722.840，北距银滩站28.9公里，南距海头站32.9公里，车站设到发线4条，按"两台夹4线"布置，车站三亚端设综合维修车间1座。设旅客进、出站地道一座，有站台柱钢筋混凝土雨棚。为线侧下式站房，站房总建筑面积6000m2。
白马井站站房以现代建筑元素来营造传统建筑风貌，人字形屋面由流畅的线条组成，赋予建筑空间予灵动感，彰显轻盈的海滨城市建筑，正面大面积玻璃幕墙与敦实的柱子，形成强烈的虚实对比，又使整个建筑显得大气稳重。站房为钢筋混凝土框架结构，钢网架金属屋面，基础形式为独立基础。
