中型博物馆多是一个涵盖了展区（含临时展区）、会议厅、办公区、库藏区、接待休闲等部分的综合体，其中库藏区多设于地下层，接待休闲多分散设于展区中，临时展区与多媒体会议厅等多设于展区的较低层，以便于设独立出入口。所以，博物馆的主要功能分区可以简化为展区部分和办公区部分（包括文物维护等部门）。根据馆中办公区与展区空间关系的不同，博物馆功能分区的布局方式大致可分为嵌入式、并联式、独立式。这三种布局方式各有长处与不足，在设计中应根据实际情况统筹考虑，灵活扬弃。
1.嵌入式
所谓嵌入式是指博物馆的办公部分位于博物馆的某一层或某几层的部分平面上，与整个展区融嵌在一起。这类布局主要适用于甲方对办公区要求的面积相对于主展区较小，或者办公区与展区各部分联系较多，当然，基地条件有限也是使用这种形式的主要原因之一。这类布局的不足是，各层平面各不相同，给建筑设计和结构设计带来一定难度，另外，办公区的位置多放在不佳位置或层面。
2.并联式
与嵌入式相对，所谓并联式，是指博物馆的办公部分与展区部分在空间和平面上划分明确，相对独立，自成体系。这类布局有利于办公区和展区的管理与独立使用。由于办公区与展区层高的不同，对建筑设计带来一定的难度，所以，并联式中型博物馆的办公区部分地上以两层居多。
3.独立式
独立式与并联式相似，同样具有独立的办公区和展区。两者不同之处是并联式博物馆在外部看是一个整体，内部分区明确，相对独立。独立式博物馆从外部看更近似于是两个或几个建筑组团，它们之间或以坡道相通，或以连廊相连。办公区与展区之间多为半通透的空间，可以与坡道或连廊结合，设置绿地、水景等室外休闲设施。几个不同区域组团还可围合成庭院式休闲场地，便于人流疏散和视觉缓冲。独立式博物馆由于组团设置的原因，往往需要大面积的基地作保障，所以这类博物馆多适用于基地面积充分的情况。
