次氯酸是主要的消毒剂，它的作用机理是：①穿透微生物的细胞壁，破坏微生物的蛋白质和酶系统；②通过氧化作用消除水中的有机和无机污染物。次氯酸的来源有次氯酸钙或氯气。次氯酸钙是氢氧化钙吸收氯气后形成的颗粒状物质，为稳定的化合物。次氯酸钙投加到水中以后会释放出氯气，因而可以用作泳池的消毒剂。投加次氯酸钙会使水中的钙离子浓度和pH升高，这对于使用软水的游泳池是有利的。应有足够的加氯量，使池水中的余氯保持在0.4～0.6 mg/L.当池水中的有机物浓度较高时，会出现NH2Cl，NHCl2及NCl3的混合物。这是由氯分子同池水中的含氮化合物发生反应而产生的。这样就失去了消毒作用，特别是NCl3会使池水散发出难闻的气味。只有进一步加大氯投加量，才能使NCl3分解，此时水中的氯浓度不再持续上升，只有等NCl3分解后才会继续上升，即专业上所谓的折点加氯。当游泳池连续一段时间未能补充足够的新鲜水时，水中的氰尿酸（Cyanuric Acid）含量过高，还会出现氯锁定现象，即氯主要以2个或3个氯分子联合体的形式存在，从而失去了消毒作用。对于氰尿酸达到多少浓度时会发生这种情况尚未定论，一般认为其浓度在160 mg/L左右时氯锁定效应最为明显。池水发生氯锁定以后，加大氯投加量可以缓解这一情况，但长久之计是补充更多的新鲜水。
另一方面，氰尿酸可以起到氯稳定剂的作用，它在水中保持在较低的浓度是有利的，可以避免阳光中的紫外线消耗水中的余氯。通常以颗粒物的形式投加到水中，也可以在二氯联合体或三氯联合体溶解到水中的过程中产生：氯联合体分裂为单独的氯分子，同时产生氰尿酸。因此，如果泳池中投加了氯联合体，就不需要额外投加氯稳定剂。然而，当使用次氯酸钠或次氯酸钙作为消毒剂时，就需要投加氯稳定剂。应当注意避免把上述物质在干燥的状态下混合，那样会有危险。
特殊的情况下，在池水中一次投加超量的次氯酸钠或次氯酸钙，形成较高的氯浓度，抑制藻类生长和降低难闻的氯仿气味，还能够破坏聚集在一起的有机污染物。此外，一次性通入过量氯气，使池水中的氯浓度达到10 mg/L左右，可有效防止细菌和藻类繁殖，家庭泳池可每周一次进行这样的处理。
