水麦冬用分株繁殖。每一母株可分种苗1-4株。各地麦冬栽培品种较多，据调查了解发展的四川遂宁麦冬品种，抗病性强，产量高。各地可选用优良品种。麦冬收获时，将割去块根的苗，选健壮者留作种用。用刀切去根状茎下部和须根，保留上部茎节部分以叶片不散开为准，其横切面呈现白色放射状花纹（俗称菊花心），根状茎不宜保留过长，否则裁后会发生两重茎节（俗称高脚苗），生长的块根较少，产量低。根状茎切除后，将合格的苗子整理齐，用稻草捆成捆，以备栽植。浙江认为叶片过长，会消耗种苗水分，操作也不方便，因此，将上部叶片截除，只留5-6厘米长，根全部切除。

普通收获1公顷麦冬，可供3-4公顷地作种苗。种苗准备好后，应随即栽植，若不能立即栽植，应将种苗捆好把下部在水中浸湿，并用少许泥土包围，每日喷少许水，可保留数日。

四川麦冬适宜的栽植时期在4月间，浙江则在5-6月初栽植。四川麦冬栽植时，先按行距10-13厘米开沟，深5-6厘米左右，在沟内每隔6-8厘米，放种苗2-4株，垂直放于沟中，然后将土填满浅沟，用扁锄推压或用脚踩，将种苗两侧的覆土压紧。裁后立即灌透水一次，每公顷约需种苗10500千克。浙江麦冬栽种，先用种刀切开土壤开沟，二年收获的行珠距20厘米*16厘米，3年收获的，行株距26-33厘米*20-23厘米，每穴栽苗8~9株，同一丛苗基部要整齐，垂直入土，然后将上压实，深约4厘米左右。

在麦冬主产区，广大药农习惯在麦冬地里间作，不仅能增加收入，而且有利于麦冬生长，进行间作可以减少烈日直射。四川产区夏、秋两季一般多套种两季玉米（每6行麦冬套种一行玉米），冬季间种大蒜等。