麦冬主要病害是黑斑病，雨季发病严重。防治方法：选用健壮无病植株做种株，栽前用1：1：100波尔多液浸5分钟；雨季及时排除积水，降低田间湿度；发病初期，在清晨露水未干时每亩撒草木灰100公斤；发病期间，喷洒1：1：100波尔多液或65%代森锌500倍液，每10天1次，连续3-4次。
麦冬主要虫害是根结线虫。防治方法：实与禾本科作物轮作，前作或间作物不选甘薯、豆角、土豆等根性蔬菜；结合整地每亩施20%甲基异硫磷乳剂或5%颗粒剂250-300克，做成毒土撒于畦沟内，翻入土中，可防治线虫。蛴螬在8-9月发生，用90%敌百虫200倍液喷杀即可。
