落叶松幼苗常见的病害有猝倒病、松杨锈病、植苗高温伤害、早期落叶病等。猝倒病又称立枯病，防治时用1％～3％硫酸亚铁，0.4％高锰酸钾溶液喷浇苗床20min后清水洗苗，每10d一次或喷200倍波尔多液，发病轻时10～15d喷一次。松杨锈病防治采用苗圃周围不栽植杨树林，4月未5月初，用0.8％～1.0％消尔多病喷洒，如病害发生将1％粉锈宁溶液用喷雾器喷施，如施药后24h遇雨应补喷。松苗高温伤害采用改良土壤结构，适时浇水，适当早播，使苗木早期木质化，增强苗木抗性等方法。虫害以地下害虫危害较多。在北方地区，主要有金龟子、地老虎、蝼蛄、沟叩头虫等，防治地下害虫可以根据其成虫羽化期进行毒饵和黑光灯诱杀，在化学防治上用20％乐果，25％辛硫磷防治，都可以有效地杀死幼虫。
