正常操作条件下电泳漆以1.65kgf/cm的压力进入滤管，以0.35kgf/ cm压力被排出滤管，这时滤管内壁的压力差0.07-0.14kgf/cm。这样，当漆流经滤管时它有足够的压力使渗透液渗过薄膜。并从渗透液上出口排出。有时需关闭阀门，停止渗透液流出，使渗透液在滤管里处于“循环”状态。这时，滤管内压力升至于1kgf/ cm，相当于进出口压力的平均值。由于滤管进口的压力仍然比滤管内的压力高，滤管下半部流到滤管上半部去，从而清洗了滤管壁。这种循环，使一半滤管能获得逆流清洗，而不必中断电泳漆流动，也不会引进其它污染杂质。采用这循环操作，结合改变电泳漆流动方向，可使整个滤管，得到逆流清洗。这种循环操作，由于能在保持电泳漆和渗透漆流动的条件下，获得清洗效果，对延长滤管使用寿命，保持滤管最佳效果是至为重要的。新滤管装有甘油，以防运输过程中空滤管纤维干燥。故新滤管使用前，必须用水彻底清干净，至少冲洗10分钟，避免漆被污染。最佳操作压力为：漆进入为1.65大气压，由于薄膜纤维脆弱。薄膜里外的压差过大，易使薄膜破裂，纤维断裂，引起渗透液污染。因此，初次使用超滤机，应按下列步骤泵入滤管。关闭渗透液出口，然后逐渐增至正常量。开始时流量低，然后逐渐增至正常量。由于离心泵往往压力大，以至会突然送出一个很大的流量，故最好在泵的后面安一个节流阀，防止流量突然过大。建议在漆槽和滤管之间安装一个粗滤器或厚度200um以上的滤纸。以防止金属颗粒弄破滤管薄膜。