前面所述的土壤形态可称为土壤大形态，而土壤微形态是土壤形态学研究的进一步深入。土壤微形态学是指通过光学或电子学放大的方法观察土壤内部细微形象的科学。
土壤微形态研究的主要内容是土壤微垒结或称土壤微构造。
是由骨骼颗粒（skeletongrains）、细粒物质（plasma）和孔隙（voids）组成的。
(
骨骼颗粒)
是指土中大于2微米的矿物质颗粒和有机残遗物，在土壤形成过程中比较稳定，不易移动、再组织或凝聚。进一步细分时，大于10微米的叫骨骼颗粒，2—10微米的叫微骨骼颗粒（microscopicskeletongrains），再按骨骼颗粒的特征和矿物组成又可细分为斑晶骨骼颗粒、粉砂质骨骼颗粒、微晶方解石颗粒等。
(细粒物质)
是指土壤形成过程中可移动、再组织和凝聚的部分，包括骨骼颗粒以外的细粉砂、粘粒、游离氧化物和腐殖质等土壤物质。土壤孔隙，指固体土壤之间的空隙。土壤基体易与其周围一般物质相区分的单独物体，称土壤形成物相（pedologicalteatures）它是反映特定的土壤形成过程的结果。细粒物质微结（plasmicfabric）是土壤基体中细粒物质所仅有的土壤形成物相，是指细粒物质组成分在组合排列上起了明显变化的离析物，也称为细粒物质离析物（plasmicseparation）。
（soilmicroscopicfabric）是指可以借助显微镜对未破坏构造的土壤薄片进行研究的土壤垒结状况。不同的土类具有不同的微垒结特征。土壤微垒结是四相结构系统，其固相基质构成所谓的土壤基体（S-matrix）。土壤基体可理解为最简单的（原始的）结构体范围内的物质，或者是构成非结构的，无结构的块体的物质，其内可以有新生体出现。
土壤微垒结的分类是土壤微形态学的核心。这种分类主要包括两个方面：一是土壤中的粗颗粒（称为骨骼颗粒，一般大于粉砂粒）与细微颗粒（称为细粒物质，包括细粉砂、粘粒、游离三二氧化物和腐殖质等）的“相关分布格式”（relateddistributionpattern）的类型；二是土壤中细粒物质所特有的微垒结，即细粒物质微垒结，它表现为“光性方位格式”（orientationpattern），指土壤细微颗粒在正交偏光镜下的消光格式和异向性（anisotropy）。这种分类是单纯以形态为根据的，不涉及其发生学根源，因为同一土壤微垒结可以从不同的发生学过程而来。
土壤微垒结分类中的基本类型
库比恩纳（W.L.Kübiena，1938）对土壤中的粗颗粒与细微颗粒的相关分布格式进行研究，他根据土壤中矿物粗颗粒与细微颗粒两种基本现象：一是矿物粗颗粒是裸露的还是外膜的，二是细粒物质呈何种形状而存在，如外膜、桥键、支撑物、矿物颗粒间隙中的团聚体，或作为矿物粗颗粒的嵌埋介质。1973年R.Brewer在库比恩纳的分类基础上新分出裸露的骨架成分、包被的骨架成分、嵌埋的骨架成分等分类体系，在各体系中还进行了更细的划分。应当指出，这种简单的相关分布的微垒结类型还不能概括含有各种土壤物相，如多种胶膜、结核等等的土壤形态类型。
对于不透明或弱透明厚层（25μ）土壤薄片，往往遮蔽了结晶的和异向性的颗粒，在高倍显微镜下，由于聚光力强而能见到细粒物质离析物的光柱方位格式，因此按光柱方位格式分出离析物的和无离析物的细粒物质微垒结（sepicandasepicplasmicfabric）、波动消光的细粒物质微垒结（undulicplasmicfabric）、内质细粒物质微垒结（isoficplasmicfabric）、晶质细粒和复合细粒物质微垒结（crysticandcompoundplasmicfabric）等类型。
