α-巯基乙醇主要用于血清学检查凝集试验。其临床意义:当其实验值>1∶50为阳性健康搜索，布氏杆菌病符合率为93.88%。 β-巯基乙醇主要用于生产低聚合度聚氯乙烯的链转移剂，腈纶的终止剂。也可用于合成高分子材料的调聚剂、聚合催化剂、交联剂及树脂固化剂等，也可用于合成橡胶、照相、医药、油漆、纺织、金属钝化剂等行业。

巯基乙醇 危险品!经皮肤、吞咽吸收有致命危险;刺激眼睛、呼吸道粘膜，引起慢性咽炎!

β-巯基乙醇在生物实验上的意义:二硫键被打开后可以使蛋白质的四级或三级结构被破坏。由于β-巯基乙醇能够打开蛋白质的结构，它常常被用于蛋白质分析。而β-巯基乙醇也常常被用于保护蛋白质中自由的半胱氨酸巯基之间不会错误形成二硫键。

作为还原剂，2-巯基乙醇常常可以与二硫苏糖醇(DTT)或三(2-甲酰乙基)膦盐酸盐(TCEP)互换使用。

β-巯基乙醇是少数几种被发现可以延长小鼠寿命的化合物。在微克量级水平上，2-巯基乙醇被观察到对实验鼠的生命具有多种可能的正面效应。