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一般较微小，直立生长，自然分殖率极低，栽植用土量不大。一种形象的说法是生长于贫瘠的土壤中时，根茎为小手指般大小；生长于定期施肥的肥沃土壤中时，根茎则为大拇指般大小。具有这一根茎类型的睡莲品种最少，通常为微型或小型品种，如“海尔芙拉”（鹅黄色）、“白子午莲”（白色）、“红侏儒”（红色）等，矮睡莲则为其代表种。
