八达通是香港的一种电子货币收费系统，内置芯片，使用时把卡片放在接收器上即能完成付款过程。

港铁采用综合收费系统。乘客如乘搭超过一程车，多数情况下都只需付出车费最高的一程车资，其前后的各一程车都被视为接驳用途(需符合如车费上限及时间的限制)，不另收费。

注意事项:出闸或入闸后一分钟后方可再次使用

巴士免费转乘优惠:必须于指定东铁线车站出闸后45分钟内再于指定巴士八达通收费器确认，或于指定巴士八达通收费器确认后60分钟内再于指定东铁线沿途各站入闸 巴士免费转乘优惠不可以与机场快线免费港铁接驳服务共用; 使用"机场快线旅游票"(一程或两程机场快线单程车程及连续3天无限次乘搭港铁车程仍然有效期间)不会享有巴士免费转乘优惠。

单程票是附有磁带只可以在购买当天作一次性使用车票，于入闸前先行购买。车站设有自动售卖机售卖。单程车票分为普通等及头等作乘坐不同种别车厢用，乘客可预先多购一张车票作回程之用。

"全月通"是以八达通作平台的月票，其月票记录在八达通的内置芯片内。

全月通使用者可以无限次乘搭东铁线尖东至上水各站普通等(马场站、罗湖站及落马洲站除外)，及马鞍山线所有车站;亦可免费转乘港铁接驳巴士K12(星期日及公共假期除外)、K14、K16、K17、K18。;若使用该月票往/返马场站、罗湖站或落马洲站会被扣除正价车资。除指定路线外，全月通不可享有其他接驳服务的转乘优惠。

海洋公园-港铁"逍遥特惠"

。两铁合并后，港铁公司暂时保留了此套票推广活动，并推出新界全日通或过境来回票，但是其后由于票务系统技术问题，过境来回票扩展适用范围及新界全日通最后被游客全日通取代，因此推广期至2008年8月31日止。

落马洲套票

乘搭东铁线往返尖东站至上水站之间各站，会被当作往返落马洲站车程。"落马洲周票"售价为港币240元。

适用于指定星期日起7天内(有关日期打印于车票上)乘搭东铁线尖东至上水各站往返落马洲站普通等车程12次。2008年7月27日，因应配合港铁测试统一票务系统作前期工作，"落马洲周票"推广期完结(按:港铁原本有意再延长"落马洲周票"的推广期，但因港铁为统一票务系统作准备而放弃)

九铁公司推出与海洋公园合作的套票，包括海洋公园即日日间门票、穿梭巴士券2张及九铁本地线乘车证或九铁罗湖线乘车证，售价为港币109-258元，另设净交通套票(即不包括海洋公园日间门票)，售价为港币25至70元，由于反应良好，2007年初，九铁把与海洋公园合作的套票推广活动改为长期计划。

两铁合并后，港铁公司暂时保留了此套票推广活动，并推出新界全日通或过境来回票。但是其后由于票务系统技术问题，过境来回票将会扩展适用范围及新界全日通最后被游客全日通取代，因此推广期至2008年8月31日止。

主条目:落马洲周票

前往落马洲站过境乘客而设，推出的目的是刺激自落马洲支线通车后利用客低迷的情况。罗湖站或马鞍山线沿线各站(不包括大围站)出闸，会被当作无票;而乘搭东铁线往返尖东至上水之间各站，会被当作往返落马洲站车程。 "落马洲周票"售价为港币240元。

优惠期2007年11月4日至2008年7月26日期间的优惠车票，于各东铁线沿线各站(罗湖站、马场站及马鞍山线沿线各站除外)客务中心发售。适用于指定星期日起7天内(有关日期打印于车票上)乘搭东铁线红磡至上水各站往返落马洲站普通等车程12次。