全世界栽培的球根花卉有数百种，其中属单子叶植物的约10个科;属双子叶植物的约8个科。按地下部分的器官形态，可分为下列种类:

地下茎是由肥厚多肉的叶变形体即鳞片抱合而成，鳞片生于茎盘上，茎盘上鳞片发生腋芽，腋芽成长肥大便成为新的鳞茎。鳞茎又可以分为有皮鳞茎和无皮鳞茎两类，有皮鳞茎类球根花卉有水仙花、郁金香、朱顶红、风信子、文殊兰、百子莲、石蒜等，无皮鳞茎类有百合、贝母等等。

地下茎呈实心球状或扁球形，有明显的环状茎节，节上有侧芽，外被膜质鞘，顶芽发达。细根生于球基部，开花前后发生粗大的牵引根，除支持地上部外，还能使母球上着生的新球不露出地面。这类球根花卉有唐菖蒲、小苍兰、西班牙鸢尾、番红花、秋水仙、观音兰、虎眼万年青等。

地下茎或地上茎膨大呈不规则实心块状或球状，表面无环状节痕，根系自块茎底部发生，顶端有几个发芽点，这类球根花卉有白头翁、花叶芋、马蹄莲、仙客来、大岩桐、球根秋海棠、花毛茛等。

地下茎肥大呈根状，上面具有明显的节和节间。节上有小而退化的鳞片叶，叶腋有腋芽，尤以根茎顶端侧芽较多，由此发育为地上枝，并产生不定根。这类球根花卉有美人蕉、荷花、姜花、睡莲、鸢尾、六出花等。

由不定根或侧根膨大形成。休眠芽着生在根颈附近，由此萌发新梢，新根伸长后下部又生成多数新块根。分株繁殖时，必须附有块根末端的根颈。这类球根花卉有大丽花、花毛茛等。