对指纹扫描(无论使用什么方法)只是匹配过程的开始。匹配过程中第一步为注册。信息技术中，生物匹配的目的是验证。这意味着必须首先定义用户 ID，然后注册与该用户 ID 相关的指纹。当注册指纹时，必须重复将一个手指呈现给传感器，直至注册软件已从该手指上捕获了在未来进行指纹验证时足以能够识别指纹的信息。通常，三次测量足以实现这一目的。 如果放置一个手指进行验证，连接在指纹识别器上的软件匹配器便对所放置的手指图像进行分析，并将其与该指纹识别器所具有的已注册指纹进行比较。如果匹配，便通过了验证。如果不匹配，便通不过验证。

指纹匹配战略有三种:

细节匹配器。如同大多数警匪剧中所使用的，这是指纹匹配的原始方法。其寻找指纹中嵴线形成的唯一模式，包括嵴线末端的位置和它们分*的方式。嵴线末端或分*点称为"节点"。一些节点数被视为指纹注册的一部分。当指纹与已注册指纹进行比较时，匹配器会寻找所呈现的指纹中与保存的已注册指纹中相同的节点。如果各点间出现足够的匹配，则有效 ID 便被确定。从计算上讲，这很容易快速执行，并且需要的程序较小。执行匹配时，它在这三种方式中错误率最高。保存的数据就是一系列节点，而非手指图像。相关匹配器。这种方法更加复杂，它将两种指纹的所有方面进行比较，以寻找匹配。这些特性包括嵴线宽度、沟宽度、嵴线的方向与排列，以及其它众多因素。从计算上讲，这比细节更苛刻。其程序较大且缓慢。总体上它比细节匹配器更可*。相关匹配器保存了已注册指纹的图像。细节匹配器与相关匹配器的组合。这是一种新的方法，它将这两种战略相结合，获得了如同细节匹配器一般小和快、如同相关匹配器一样可靠的优势。