钼在地壳中的元素丰度约为1×10-6，在岩浆岩中以花岗岩类含钼最高，达2×10-6。钼在地球化学分类中，属于过渡性的亲铁元素。在内生成矿作用中，钼主要与硫结合，生成辉钼矿。其他较常见的含钼矿物还有铁钼华([Fe3+(MoO4)8·8H2O])，钼酸钙矿(CaMoO4)，彩钼铅矿(PbMoO4)，胶硫钼矿(MoS2)，蓝钼矿(Mo3O8·nH2O)等。

辉钼矿(MoS2)是自然界中已知的30余种含钼矿物中分布最广并具有现实工业价值的钼矿物。辉钼矿为铅灰色，与石墨近似，有金属光泽，属六方晶系，晶体常 呈六方片状，底面常有花纹，质软有滑感，片薄有挠性。比重4.7~4.8，硬度为1~1.5 ，熔点为795℃，MoS 2 划在陶瓷板上的条痕为浅绿灰色或浅绿黑色，加热至400~500℃时MoS 2 很容易氧化而生成MoS 3 ，硝酸和王水都能使辉钼矿(MoS 2 )分解。辉钼矿MoS 2 用于生产钼铁合金、金属钼、钼酸钙、钼酸铵、润滑剂等。