狭义藤黄科下可分4亚科：

①Kielmeyeroideae亚科，叶互生或对生；花通常两性;雄蕊多数;花柱1,子房3～5室。主要属有：Kielmeyera、Caraipa。

②胡桐亚科,叶对生；花两性或单性,同株,稀异株;雄蕊多数,分离或基部合生,子房1～4室,每室胚珠1～2;果不开裂;子叶大而厚。主要属有：铁力木属(中国有栽培)、Mammea属、胡桐属(中国亦产)、Endodesmia、黄果木属(Ochrocarpus，中国亦产)。

③藤黄亚科，叶对生；花杂性或两性，稀单生，同株或异株；雄蕊多数，分离或合生成束；子房(1～)2～12室或更多，每室胚珠通常1个；果各式;子叶极小或无。主要属有：Clusia、藤黄属(中国亦产)。

④猪油果亚科，叶对生；花两性，同株；雄蕊多数，基部合生成5束或合生成雄蕊管；花柱长，柱头5裂；果为浆果；无假种皮，胚不分化。主要属有：猪油果属（中国有栽培）、Moronobea、Symphonia。