绿花杓兰植株高30-60厘米，具较粗短的根状茎。茎直立，被短柔毛，基部具数枚鞘，鞘上方具4-5枚叶。叶片椭圆状至卵状披针形，长10-18厘米，宽6-8厘米，先端渐尖，无毛或在背面近基部被短柔毛。
花序顶生，通常具2-3花；花苞片叶状，卵状披针形或披针形，长4-10厘米，宽1-3厘米，先端尾状渐尖，通常无毛，偶见背面脉上被疏柔毛；花梗和子房长2.5-4厘米，密被白色腺毛；花绿色至绿黄色；中萼片卵状披针形，长3.5-4.5厘米，宽1-1.5厘米，先端渐尖，背面脉上和近基部处稍有短柔毛；合萼片与中萼片相似，先端2浅裂。
花瓣线状披针形，长4-5厘米，宽5-7毫米，先端渐尖，通常稍扭转，内表面基部和背面中脉上有短柔毛；唇瓣深囊状，椭圆形，长2厘米，宽1.5厘米，囊底有毛，囊外无毛；退化雄蕊椭圆形或卵状椭圆形，长6-7毫米，宽3-4毫米，基部具长2-3毫米的柄，背面有龙骨状突起。
蒴果近椭圆形或狭椭圆形，长达3.5厘米，宽约1.2厘米，被毛。花期4-5月，果期7-9月。
