小掌唇兰根稍扁，细长，多少弯曲并且具短分枝。茎质地硬，斜立，长3-16厘米，粗5-7毫米，有时具分枝，节间长5-7毫米，具多数二列互生的叶。叶革质，狭长圆形，长10-16厘米，宽9-18毫米，先端钝并且稍不等侧2裂，基部具关节和宿存的鞘。

花序与叶对生，斜立，1-5个，不分枝，长5-8厘米，疏生少数花；花序柄纤细，粗1-1.5毫米；花苞片三角形，长2毫米，先端急尖；花梗和子房长约6毫米；花小，稍肉质，开展，萼片和花瓣黄色带紫褐色斑点；中萼片近匙形，上半部凹的，长5毫米，宽2.5毫米，先端锐尖，具1条脉；侧萼片斜倒卵形，长5毫米，宽3毫米，先端钝，具1条脉。

花瓣斜倒卵形，长4.5毫米，宽2.5毫米，先端钝，具1条脉；唇瓣白色，肉质，长约6毫米，基部具长2毫米而上面凹槽状密布长毛的爪，上半部3裂；侧裂片近长圆形，长2毫米，宽1.5毫米，先端斜截；中裂片厚肉质，近方形，长2毫米，宽3毫米，先端近截形，上面多少疣状突起；唇盘中央黄色，具1个深穴；距圆筒形，长2.5毫米，粗1.5毫米，末端钝，内面背壁上具1枚密生毛的舌状附属物；蕊柱粗短，长约2毫米，密布细乳突状毛，尤其在药床周边；蕊喙厚肉质，先端2裂，多少向上翘起；药帽前端伸长而收窄为狭三角形，先端稍向上翘；粘盘柄匙形，长约1.5毫米；粘盘质地很厚，椭圆形，比粘盘柄基部宽，不裂。

蒴果细圆柱形，长4-5厘米，粗5毫米。花期1-3月，果期6月。