1、用给水或产品水进行低压冲洗，以去除设备运行时的浓水和污染物。

2、按制造商的说明配制清洗液。(在此之前须根据具体情况确定污染种类)。

3、将清洗液加入到第一段中并保持60分钟(对小系统不分段，可一次性清洗)，此时你可能需要调节流量缓慢增加，防止清除出来的污染物将给水通道堵塞。在将清洗液回流到RO清洗箱之前应排放掉从系统中的水和刚开始的20%的清洗液。当PH值变化超过0.5单位时，重新调到目标值。

4、可选择浸泡和再循环步骤。浸泡时间为1小时至一夜，视制造商的建议而定。但是应该注意保持正确的温度和PH值，而且这也会增加膜与清洗药品的接触时间。

5、用产品水进行低压冲洗，以去除在清洗系统各反渗透系统中的所有残存药品。

6、一旦某设备的所有各段均清洗完成后，该RO装置可以重新投入运行。通常RO的产水水质要用数小时甚至几天的时间才能稳定下来，尤其是在经过高PH溶液清洗之后。