自生矿物与生物矿物(Biogenic Minerals)亦相异，生物矿物由生物的坚硬部分组成，或是在沉积当地出生物排泄之沉淀物所形成的。自生矿物是成岩过程中的主要产物，并产生于几乎所有类型的沉积岩内，而其含量为微量至多量。最普遍的自生矿物为方解石及白云石，而形成石灰岩及
白云岩。石灰岩内的方解石的大部分原自霰石，但大部分的白云石由方解石的化学蚀变作用所形成。燧石(Chert，Flint，Jasper，碧玉)常常由微晶质石英(玉髓)组成，而时含方英石，白矽石，Cristobalite。砂岩的碎屑矿物常常由自生石英、方解石、白云石、氧化铁，或针铁矿(Goethite)胶结，又可见碎屑石英粒的自生石英的过生长(Overgrowth)及碎屑长石粒的自生长石的过生长。又在页岩内常常含自生黄铁矿及白铁矿。
