1、河流形态空间的异质性原则
一个地区的生境空间异质性越高，就意味着创造了多样的小生境，能够允许更多的物种共存。反之，如果非生物环境变得单调，生物群落多样性必然会下降，生物群落的性质、密度和比例等都会发生变化，造成生态系统某种程度的退化。南水北调是一项艰巨的工程，这涉及到了中国南北方的重要流域，根据河流形态空间的异质性原则，我们要打造符合自然河流的地貌为动植物提供更广阔的生活家园。根据南水北调中线地区的环境进行生物调查、地貌历史和现状进行勘测，建立关于河流的数据库。在此基础上，确定环境因子和生物因子之间的关系，所谓的环境因子就是河流、河势、水温、水位、水质、以及水文的周期变化等。生物因子就是包括各种微生物和动植物等、使二者之间进行相互合作，环境为生物提供家园，同时生物又可以保护家园，这样的设计是符合生态发展的。
2、景观尺度原则
建设生态水利工程还必须要考虑到景观尺度的问题，这是一个比较综合的问题，要用全面的眼光看待此问题，生态水利的建设，不是只顾局部地段的建设，而是全面的进行大规模的生态改革，从生态系统的结构和功能出发制定方案，考虑各生态要素之间的关系。由于南水北调中线地域环境复杂，水系的支流较多，就要考虑各地区之间的优缺点，理论联系实际，实事求是，根据景观尺度原则，在大景观尺度上开展河流生态修复。
3、南水北调中线工程的调水方针
南水北调中线工程遵循“先节水后调水，先治污后通水，先环保后用水”的三先三后调水方针，这一方针是本着“以人为本、全面协调可持续的科学发展观、绿色、生态、环保”的原则进行开展的。节水是不浪费的原则，治污是环保的原则，环保是绿色的原则，在这三个前提之下进行调水工作，为华北地区提供干净清洁的水源，同时对主渠道两侧又不会造成生态破坏，可以说是一个两全其美的方针。
4、南水北调中线工程的生态效益
在施工的过程中，国家通过政策手段鼓励当地群众进行退耕还林、还绿地，在主渠道周围建设防护林，竣工后，森林面积可以增加17371平方米，蓄水功能将增大了1737万立方米，可以释放氧气10万吨每年，同时还可吸收二氧化碳12万吨每年，每年还可以吸收空气中的粉尘52万吨，工业上排放的二氧化硫每年被吸附5000吨，由于生态环境的改变，这里也成了鸟的天堂，据统计，每年有近10万只候鸟在此栖息。改善了当地垃圾污染的局面，起到了防风固沙的作用，使土地变得更加肥沃，含水量远远大于从前，改善了当地的气候环境，维护了生态平衡，降低了自然灾害的频率，改善了当地居民的居住环境。此外，在这里还发展了绿色的有机农业，城市与农村形成了一道独特的人文景观和自然景观。随着南水北调中线工程的竣工，可以缓解华北地区对地下水的开采，同时也带动了沿岸的经济发展。南水北调中线工程对改善华北地区的生态环境做出了巨大贡献。
