1）构建水生植被。种植一些沉水植物，如黑藻、金鱼藻、苦草等和浮叶植物睡莲，可以很好地转化水和底泥中的氮、磷、钾等营养物，同时还能降低水体N，P，K及必需微量元素的含量与周转速率，抑制浮游植物生长，也能为水生生物提供良好的生存环境，提高水体的自净能力。
2）构建水生动物种群。适当的对一些螺、鲫等水生物的种群数量进行提高，能够消耗更多的浮游植物、有机碎屑、腐碎、巨大的微生物生物量等，为生态平衡做出贡献。
3）种植水生花卉。如果整治的是城市段的河道，应该多种植各优质品种的睡莲，这样既能起到美化的作用，又能优化水质。
