天生桥二级水电站是一座高水头引水式水电站。坝上游库容很小，泥沙会很快淤到坝前，枢纽的首要任务是处理库内淤积问题。水库调度的原则应当是，在减少库区淤积、减少进洞沙量、确保运行安全的前提下，充分满足发电需要。天生桥一级水电站建成后，二级水电站泥沙问题将得到缓解，进一步考虑提高发电要求，调整运行方式。天生桥二级水电站初设阶段规定的正常蓄水位是645.0米，汛期限制水位637.0米.根据天然河道来水来沙条件及枢纽的防排沙要求，参考水库淤积计算及模型试验资料，制定的调度方式即:

(1)枯水期，河道流量小于800立方米/秒时，坝前水库水位壅高到设计蓄水位645.0米运行;

(2)初汛期，河道平均流量为800立方米/秒左右，坝前水位降到640.0米运行;

(3)汛期头场洪水涨峰阶段，坝前水位稳定在640.0米，随着落峰再逐渐降到637.0米运行;

(4)以后各次涨落峰时均稳定在637.0米运行。但当流量小于800立方米/秒时，坝前水位仍壅高到645.0米运行。

这种调度方式能使库区床面在较长时间内控制在较低高程，同时又能缓冲头场洪水溯源冲刷的势头，减少进洞的沙量。