红山金矿区大地构造背景属天山地槽北天山地向斜褶皱带，位于康古尔与苦水断裂间狭长的含金韧性剪切带东段北缘，出露地层为中下石炭统.华力西中晚期的多期次岩浆活动、韧性剪切作用和构造活动叠加形成了一系列金及多金属矿床，已成为新疆东部主要的产金基地.通过对红山金矿床地质特征的研究，从宏观及微观尺度进行成矿条件分析，发现金的富集与多金属硫化物，尤其是与方铅矿关系密切.其主要特征是贫黄铁矿，多金属硫化物较少，局部富含方铅矿，金的分布极不均匀.金具多源性，主要来自岩浆，少量来自围岩.剪切作用多次叠加及强烈糜棱岩化，使金矿物与多金属硫化物多沿糜棱面理及显微裂隙分布，最终导致工业矿体侵位，形成糜棱岩型、超糜棱岩型金矿床。

糜棱岩是北祁连南缘右行韧性走滑剪切带内的主要构造岩类型，其中主要矿物都发生不同程度的塑性变形。石榴石内矿物包裹体的痕迹、长英质矿物的定向分布及矿物间的接触关系等表明糜棱岩中的矿物为同构造生长的产物。石榴石、黑云母、白云母和斜长石的矿物化学成分特点表明糜棱岩的变质程度达角闪岩相，形成于高温环境。石榴石徽区成分存在两种类型:一种为环带型，从核部到边缘，MnO含量从中心向边缘逐渐降低，FeO和MgO含量逐渐增加，反映石榴石形成于递进变质环境;另一种为均一型，显示剪切带内局部变质作用的强度继续增大，温度进一步升高(>600℃)，组分扩散能力的提高使石榴石内的环带部分或全部均一化。矿物化学成分温压计的计算结果表明矿物形成温度为651~763℃，压力为6.2×10^8~8.4×10^8Pa,，据此。推测该韧性剪切带形成于地下17~19km，后随祁连加里东造山带一起隆升出露地表。