微溶与乙醇，易溶于水，水溶液呈弱碱性。摇振时产生大量泡沫。长期暴露空气中易吸潮。静止贮存时，有鱼眼珠状结晶析出。其性质稳定，耐光、耐压、耐热、无挥发性。通常工业品是含40%或50%有效成分的水溶液，呈无色或浅黄色粘稠液体，有芳香气味并带苦仁味。含有效成分50%的产品相对密度0.980，粘度为60mPa*s，PH值为6~8.

氯化十二烷基苄基铵是一种阳离子表面活性剂，属非氧化性杀菌剂，具有广谱、高效的杀菌灭藻能力，能有效地控制水中菌藻繁殖和粘泥生长，并具有良好的粘泥剥离作用和一定的分散、渗透作用，同时具有一定的去油、除臭能力和缓蚀作用。

氯化十二烷基苄基铵毒性小，无积累性毒性，并易溶于水，并不受水硬度影响，因此广泛应用于石油、化工、电力、纺织等行业的循环冷却水系统中，用以控制循环冷却水系统菌藻滋生，对杀灭硫酸盐还原菌有特效。

氯化十二烷基苄基铵可作为纺织印染行业的杀菌防霉剂及柔软剂、抗静电剂、乳化剂、调理剂等。