药用木瓜鲜果中含有较多的单宁和有机酸，糖含量相对较低，使其口感酸涩，不宜生食。但其果实营养丰富，富含维生素。木瓜中酸类成分包括苹果酸、枸橼酸、酒石酸等，这些有机酸都具有纯正的酸味，经过适当稀释并辅以一定的甜味剂如蔗糖或蜂蜜后，可制成风味独特的产品。

保健功能明显，以木瓜为原料，现已开发成功上市的产品主要有木瓜果汁饮料、木瓜蜜饯、木瓜果酒、木瓜果醋等。现正研究开发从木瓜中提取超氧化物歧化酶SOD抗衰老制剂、木瓜复合抗氧化精华素（保健食品）、现代木瓜单味中药浓缩颗粒、低温真空干制木瓜饮片、木瓜蜜液泡腾片。木瓜果粉等类型的食品初试和中试均已获得成功，不久即可投入生产。木瓜果实加工产品也可用做化工、化妆品原料，做饲料或添加剂。美容产品木瓜白肤香皂、香花雨木瓜白肤洗面奶、木瓜牛奶白肤沐浴露、木瓜白肤护手霜、提取木瓜复合抗氧化精华素等，这些产品在北美和欧洲市场非常受欢迎，前景广阔。

木瓜鲜美兼具食疗作用，尤其对女性更有美容功效。木瓜所含的蛋白分解酵素，可以补偿胰和肠道的分泌，补充胃液的不足，有助于分解蛋白质和淀粉。木瓜含有胡萝卜素和丰富的维生素C，它们有很强的抗氧化能力，帮助机体修复组织，消除有毒物质，增强人体免疫力，帮助机体抵抗包括甲流在内的病毒侵袭。木瓜果实中的有效成分能提高吞噬细胞的功效。

木瓜还由于树姿优美，花簇集中，花量大，花色美，常被作为观赏树种，还可做嫁接海棠的砧木，或作为盆景在庭院或园林中栽培，具有城市绿化和园林造景功能。