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机械分离法:常用于分离藻类原生质体，采用渗透方法使细胞发生质壁分离，用刀把细胞壁切破，使原生质体流出。(手工操作难度大，得率低，费时费力)
酶解分离法:用酶(琼脂酶，果胶酶，纤维素酶等)将细胞壁分解。(条件温和，原生质体完整性好，活力高，得率高) 因此原生质体制备多采用酶解法，此法操作过程分为:取材消毒，酶解制备， 原生质体收集。
