隐柱兰植株高17-50厘米。根状茎粗短，具多条根；根粗厚，肉质，长4-6厘米，粗5-7毫米。叶2-3枚，基生，叶片椭圆状卵形或椭圆形，长8.5-11厘米，宽4.5-5厘米，先端渐尖，基部圆形或钝，中肋在上面凹下，在背面隆起，上面绿色，无斑点，背面淡绿色，边缘全缘，光滑，具长柄；叶柄长6.5-11.5厘米，绿色，无斑点。

花葶从叶基部抽出，直立，高15-47厘米，细长，光滑，绿色，具2至多枚鞘状苞片，总状花序具10-20朵花，长8-10厘米；花苞片直立伸展，披针形，长1-1.5厘米，宽2-3毫米，先端渐尖，最下部的略长于或等长于子房；子房细圆柱形，不扭转，光滑，连花梗长8-14毫米；花较大，萼片线状披针形，黄绿色，长15-19毫米，宽1.5-2毫米，边缘内卷，先端渐尖，具3脉。

花瓣线形，黄绿色，长9-10毫米，宽1毫米，先端渐尖，具1脉；唇瓣位于上方，长椭圆状披针形、长椭圆状卵形或披针状卵形，大，长15-21毫米，宽5-7毫米，不裂，背面黄绿色，内面桔红色而具鲜红色斑点，近先端处略黄色，先端渐尖，基部圆形且呈浅囊状，内面有细毛；蕊柱粗短，长2毫米，粗2.8毫米；花粉团4个，成2对，黄色，粒粉质，长1.5-1.7毫米。花期5-6月。