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1直接测定法
将水样预先酸化，通入氮气曝气，驱除各种碳酸盐分解生成的二氧化碳后再注入仪器测定。曝气过程中由于挥发性有机物的损失会造成误差，故测定结果为不可吹出有机物的碳值。
2差减法
将同一等量水样分别注入高温炉（900 ℃ ）和低温炉（150 ℃ ），则水样中的有机碳和无机碳均转化为二氧化碳，低温炉的石英管中有机物不能被分解氧化。将高、低温炉中测得的总碳(TC)和无机碳(TC)二者之差即为总有机碳(TOC)。
