生于黄土高原北缘灰钙土上的短花针茅荒漠草原，位于草原与荒漠交界处，成为一条不宽的过渡带。经常混生有大量喜暖的旱生小半灌木，如牛枝子(Lespedeza potaninii)、蓍状亚菊(Ajania achilleoides)、或灌木亚菊(A.Fruticulosa)。向南接近干草原一侧，常掺入一定量的长芒草 (Stipa bungeana)、茭蒿 (Artemisia giraldii)、万年蒿 (A.Gmelinii);向北，将进入草原化荒漠带一侧，则混入驴驴蒿 (Artemisia dalailamae)、刺叶柄棘豆 (Oxytropis aciphylla) 枇杷柴等旱生小半灌木;在内蒙古高原南部具砾石的暗棕钙土上，几种旱生的锦鸡儿(狭叶锦鸡儿(Caragana stenophylla))、荒漠锦鸡儿(C.Roborovsky)、中间锦鸡儿(C.Intermedia) 等常见混生，而使短花针茅荒漠草原具灌丛化特点。有时也混生大量的冷蒿 (Artemisia frigidsa) 或戈壁针茅 (Stipa gobica)、沙生针茅 (S.Glareosa)。
祁连山地短花针茅草原上部常与西北针茅 (Stipa krylovii) 交错分布，土壤为山地栗钙土;下部伴生大量的驴驴蒿、珍珠柴(Salsola passerina)，构成山地植被自上而下由草原向荒漠的垂直过渡带。
在新疆主要分布在天山南坡海拔1000~2900米的荒漠草原草地中，土壤为淡栗钙土和棕钙土，质地为壤质或石质化很强的砾质土，在天山南坡焉耆盆地以西的冰草(Agropyron cristatum) 草原中，短花针茅为优势种之一，还有喀什蒿(Artemisia kaschgaria)、西北针茅;在石质化强的地段，出现大量的刺锦鸡儿(Caragana acanthophylla)，形成灌丛草原。在天山南坡，以短叶假木贼(Anabasis brevifolia)、沙生针茅为建群种的荒漠草原中，短花针茅是主要伴生种，还有糙隐子草(Cleistogenes squarrosa)、圆叶盐爪爪(Kalidium schrenkianum)、枇杷柴(Reaumuria soongorica)、驼绒藜(Ceratoides latens)等植物。
在博格达山南坡海拔2000~2500米的山区，短花针茅作为主要优势种，构成灌丛荒漠草原草地，其他优势种植物有荒漠锦鸡儿(Caragana roborovskyi)、中麻黄(Ephedra intermedia)、膜果麻黄(E.Przewalskii)、镰芒针茅(Stipa caucasica)等。这类草地地形崎岖，坡度大，土壤为山地棕钙土，土层薄，地面有不同程度的砾石化。
在昆仑山中段的高寒草原中也有短花针茅出现。短花针茅主要分布区，属温带干旱及半干旱带，比较喜暖，适宜≥10℃活动积温2000~3200℃，干燥度2.5~3.0。在黄土高原，常见于丘陵阳坡，而阴坡为长芒草干草原群落;向西在更干旱的河西走廊东部，它则习生于缓丘的阴坡，与阳坡的荒漠植被形成复合体。短花针茅比较耐旱，对风沙适应性强，再生快，耐牧、耐踏。在黄土高原，3月中旬有萌动，3月底返青，5月上、中旬抽穗开花，6月下旬果实成熟，10月中下旬进入枯黄期;在内蒙古高原，4月初萌动，5月下旬至6月上旬抽穗开花，7月上旬种子成熟，9月枯黄。枯黄后直至春季返青以前，在草地上保存良好，有利于冷季放牧利用。
