矿相学研究一般分3个阶段:①野外研究。在研究区域及矿床地质概况的基础上，选择有意义的矿化露头、探槽、坑道、钻孔进行地质观察和编录。同时采集供进一步研究用的矿石及矿化围岩标本。②室内研究。主要任务是进行矿相(反光)显微镜下的鉴定和研究，必要时还须进行其他一些专门性的研究(如单矿物化学分析、电子探针分析、 X射线分析、红外吸收光谱分析、电子显微镜分析、同位素年龄分析以及放射性测量等)。根据工作任务、研究目的和方法的不同，研究标本可分别制成磨光块(矿块)、磨光片(光片)、光薄片和砂光片等。对这些加工过的标本在显微镜下进行研究，可比野外更深入地了解矿石的物质成分和形态特征。③综合整理。综合野外和室内研究的成果和文献资料，编写矿相学综合研究报告，为解释矿床成因，指导矿石技术加工工艺性能提供依据。

矿相学研究涉及的地质问题较多，因此必须充分运用矿床地质学、矿物学(结晶学、非吸收性晶体光学等)以及地球化学方面的理论知识和新技术成果，才能深入地研究各类矿床的矿石。