1、保护生态、协调发展的原则
要把生态保护放在重要位置，尊重自然规律，从全流域生态环境保护的要求规划水库除险加固，按照可持续发展的方针，统筹考虑水库在防洪减灾、水资源开发利用与保护、改善生态环境等多方面的作用，协调好各方面的意见，处理好近期与长远的关系，实现水利工程综合效益的最大化。
2、因地制宜、合理布局的原则
由于各地水资源环境条件和经济社会发展的要求不同，水库除险加固应突出流域、区域的特点，坚持兴利与除害相结合，兼顾上下游、左右岸和有关地区之间的利益。
3、突出重点、分步实施的原则
规划要突出流域、区域中对保障国家和地区经济安全、涉及水资源配置和保护环境有重大作用的重点水库除险加固工程。要根据项目前期工作、建设条件和建设资金的筹措能力考虑经济社会发展的实际需求，按效益优先和轻重缓急，制定水库除险加固近期实施计划安排；避免在一个区域、一个时期内项目过于集中。要远近结合，统筹安排，做好建设排序。
