2005年，阿勒泰机场完成飞行起降3312架次，旅客吞吐量19.3万，货物18.3吨。

2006年6月10日复航至10月底，阿勒泰机场共保障飞行起降2432架次，旅客吞吐量194631人次，货物10.5吨。同时还保障了军航、物探、专机、包机飞行。仅2006年旺季这四个月的生产量就是阿勒泰机场建成通航至2003年新疆民航体制改革以前47年生产总量的1/2。

随着阿勒泰地区政治、经济、尤其是旅游业的快速发展。阿勒泰机场的航空业务量呈现迅猛增长的态势。2005年，完成飞行起降3312架次，旅客吞吐量19.3万人次。

2006年6月10复航至10月底，阿勒泰机场共保障飞行起降2432架次，旅客吞吐量194361人次，同时还保障了军航、物探、专机、包机飞行。仅一年生产量就是阿勒泰机场建成通航至2003年新疆民航体制改革以前47年生产总量的1/2。2006年11月19日，阿勒泰机场成功地召开了"阿勒泰机场安全运行五十周年、阿勒泰机场-南航新疆航空公司合作售票处开业庆典联谊酒会"。

2007年8月，阿勒泰机场游客接待达到最高峰，日起降班机48架次，吞吐旅客4300人次，收入240.8万元，创2007年航班量和旅客吞吐量最高记录，相较2006年分别增长29%、26%、11%。统计，2007年1至8月，阿勒泰机场共起降班机2700架次，吞吐游客19.6万人。