1992年5月新机场动工，1995年4月5日正式投入使用。所飞的航班为乌兰浩特—通辽—北京—呼和浩特往返，由国航内蒙分公司运营，机型为运七。1997年10月起，乌兰浩特—北京航班开始直飞。1998年4月，机型改为BAe-146，进一步改善了旅客的乘机环境。2000年11月，海南航空加入乌兰浩特航线的运营。国家、民航投资建设了助航灯光和专业停机坪，增强了航站的综合保障能力，飞机可以昼夜起降。2005年3月29日13点50分，随着乌兰浩特机场塔台管制员口令的发出，海航7469号飞机飞往目的地满洲里。从而拉开了乌兰浩特至满洲里航线通航的序幕，结束了两地不通航的历史。2006年12月21日，内蒙古乌兰浩特机场扩建工程一次试飞成功，兴安盟首次起降波音737-800型飞机。当天起降大、小型飞机10架次。乌兰浩特机场扩建后，可同时停放2架B737系列飞机；跑道可以满足波音737-700/800、A319、A320以下机型起降。2008年5月25日上午，乌兰浩特至北京南苑机场波音737-700型飞机首航。波音737型飞机的引进，结束了乌兰浩特机场只能飞小型飞机的历史。