第1章 导论:生物乙醇的重要性与厌氧细菌及其纤维小体的贡献1

参考文献5

第2章 纤维小体传奇:早期研究7

2.1 引言7

2.2 发现过程8

2.3 后续研究11

2.4 证据14

2.5 未来方向21

2.6 结论22

参考文献22

第3章 粘连蛋白与对接蛋白的相互作用33

3.1 引言34

3.2 粘连蛋白与对接蛋白的系统发生多样性34

3.3 粘连蛋白模块34

3.4 对接蛋白模块37

3.5 粘连蛋白?对接蛋白复合物的结构37

3.6 结合的专一性39

3.7 粘连蛋白?对接蛋白相互作用及纤维小体复合体41

3.8 结论41

参考文献42

第4章 纤维小体的催化组分49

4.1 纤维小体:超分子复合体49

4.2 结构模式50

4.3 结论58

参考文献59

第5章 热纤梭菌降解纤维素:微生物角度67

5.1 引言67

5.2 热纤梭菌的生理生态学68

5.3 纤维素水解机理68

5.4 生物能学69

5.5 纤维素酶合成的调控70

5.6 黏附机制72

5.7 生物膜反应73

5.8 最新前沿75

参考文献77

第6章 热纤梭菌纤维小体的新组分及基因组序列分析82

6.1 引言82

6.2 热纤梭菌降解纤维素过程83

6.3 热纤梭菌基因组中的纤维小体基因88

6.4 基因组中潜在的纤维小体纤维素酶基因89

6.5 基因组中组成纤维小体的半纤维素酶基因90

6.6 基因组中的糖苷酶基因91

6.7 完整的果胶酶系统92

6.8 基因组中的其他水解酶与酯酶基因92

6.9 纤维小体中非催化组分的基因93

6.10 碳水化合物结合结构模块的功能93

6.11 纤维小体蛋白的模块组装?多功能酶93

6.12 在纤维素上培养时实际存在的纤维小体组分95

6.13 纤维素水解中未确定功能组分Cel8A的可能作用96

6.14 纤维小体组成随底物的变化96

6.15 非纤维小体纤维素酶系的增补作用96

6.16 哪些纤维糊精是纤维素水解的产物97

6.17 结论99

参考文献99

第7章 噬纤维梭菌纤维小体106

7.1 引言106

7.2 噬纤维梭菌纤维小体的组成和结构107

7.3 纤维小体基因的组装109

7.4 纤维小体异质性的亚基组成109

7.5 纤维小体基因的转录和表达调节110

7.6 纤维小体的设计110

7.7 利用小型纤维小体研究协同作用111

7.8 DNA重排方法改进纤维小体酶的特性111

7.9 纤维小体基因的异源表达112

7.10 CBD的应用112

7.11 结论与注释112

参考文献113

第8章 约氏梭菌与白色瘤胃球菌的纤维小体117

8.1 约氏梭菌的纤维小体117

8.2 白色瘤胃球菌的纤维素降解系统125

参考文献127

第9章 纤维小体嵌合体:研究纤维小体功能及其潜在生物技术应用的有效工具131

9.1 引言131

9.2 纤维小体嵌合体的概念133

9.3 利用纤维小体嵌合体来研究解纤维素梭菌产生的纤维小体135

9.4 未来前景139

9.5 未来生物技术的应用140

9.6 结论141

参考文献141

第10章 黄色瘤胃球菌纤维小体的组织结构144

10.1 引言144

10.2 黄色瘤胃球菌中纤维小体的组织架构145

10.3 黄色瘤胃球菌降解植物细胞壁的其他特征152

10.4 结论153

参考文献154

第11章 解纤维梭菌:纤维小体及其纤维素水解158

11.1 引言158

11.2 纤维小体的酶组分159

11.3 纤维小体脚手架蛋白164

11.4 纤维小体166

11.5 非纤维小体的蛋白质168

11.6 纤维素降解168

11.7 结论171

参考文献172

第12章 热纤梭菌纤维素酶生物合成调控179

12.1 碳源调控179

12.2 单个纤维素酶组分的调节180

12.3 生长速率的影响180

12.4 纤维素酶基因簇181

12.5 负调节182

12.6 结论183

参考文献183

第13章 厌氧真菌的纤维小体185

13.1 引言185

13.2 厌氧真菌纤维小体的酶组分190

13.3 非催化的对接蛋白结构域(NCDD)和脚手架蛋白197

13.4 厌氧真菌中纤维素降解酶的基因组结构199

13.5 结论199

参考文献200

索引209