该物种已被列为国家Ⅱ级重点保护野生植物（国务院1999年8月4日批准）。
在有水青树生长的自然保护区内，应保护好零星散生的母树，促进天然更新，并积极开展育苗、造林；可引入植物园、树木园栽培。植物系第四纪以来留下的活化石，为中国特有种。通常较矮小，只在沟谷要中才较高大。生长较快。
水青树科，连香树科在植物系统分类学上是接近上述二科古老原始单种科，隶属它们的水青树和连香树都为中国珍稀植物。其中水青树还拥有裸子植物的解剖学特征，二者在湘南山区分布于舜皇山、源口、和大远自然保护区。
濒危种。水青树是中国的稀有珍贵树种，为单种属植物。原资源较多，由于采伐破坏，仅残留于深山、峡谷、溪边或陡坡悬岩处，多呈零星散生。
