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免疫亲和纯化是另一种可能需要纯化抗体的技术。在这一技术中，抗体共价交联到一固相基质上，如交连的琼脂糖或聚丙烯酰胺微球。常用的方法是，先将抗体纯化，然后连接到通过化学方法激活而具有结合位点的微球上。此时，抗体的纯化对实验的成功至关重要。
