本项目区域属亚热带湿润季风气候区，气象条件复杂，降雨、降雪、气温等气象要素在不同的地区和海拔高度变化显著:雅安、荥经为潮湿多雨区，汉源为少雨干燥区，石棉-泸沽为雨量中等区，泥巴山、拖乌山属季节性冰冻气候，沿线生态环境脆弱，环境保护难度非常大。
本项目为典型的山区高速公路，先后翻越海拔3000米以上的大相岭泥巴山和拖乌山，沿大渡河和楠垭河展线，分别经过煤矿采空区、花岗岩开采区、石棉尾矿区以及泥石流等地质病害多发区;通过我国著名的活动性断裂带，地震活动频繁，具有震级高、强度大的特点;还经过60余公里瀑布沟电站水库区。项目深埋特长隧道的设计与施工、高烈度地震区大跨高桥设计、双螺旋隧道、连续50公里长大纵坡的安全运营、活动断裂地区不良地质病害处治、环境和生态保护等技术难题，在全国乃至世界范围内均具有特殊性和典型性。
