三硅酸镁其实是一种抗酸药，服后能中和胃酸，作用缓慢、持久，达4~5小时，不产生气体。在反应中生成胶状氧化硅

(胶状二氧化硅)，可以覆盖在胃、十二指肠溃疡的表面，除机械保护作用外还能吸附游离酸。本品对胃酸的分泌无直接影响。其缓冲作用可导致胃内pH值升高，从而使胃酸过多症状得以缓解。其轻泻作用可能因肠黏膜释放胆囊收缩素，刺激结肠收缩而排便。

因此，食用该物质可能导致胃酸分泌低的人，出现消化不良的症状。同时，镁离子在肠道内难吸收，大剂量时由于渗透作用，可引起轻泻，故通常需要与其他制酸药制成复方制剂使用。而且，长期服用本品，少量二氧化硅被吸收并经尿道排泄，可能发生肾硅酸盐结石。肾功能不全患者长期大量服用还可出现眩晕、昏厥、心律失常或精神症状，以及异常疲乏无力(约10%的镁自肠道吸收，高镁血症或其他电解质失调)。因此，医生建议1)因本品能与磷酸根结合而阻碍磷酸盐的吸收，故低磷血症患者(如吸收不良综合征)，不宜服用本品。2)严重肾功能不全、阑尾炎、急腹症或肠梗阻、溃疡性结肠炎、慢性腹泻者禁用。3)置于儿童不能触及处。