草石斛植株矮小。茎肉质，圆柱形或多少纺锤形，长1.5-3厘米，连同叶鞘粗4-5毫米，具3-6节，当年生的被叶鞘所包裹，上年生的当叶鞘腐烂后呈显金黄色。叶二列，2-5枚，互生，在茎下部的比上部的短小，草质，长圆形，长1-2.5厘米，宽4-6毫米，先端钝并且不等侧2裂，基部扩大为鞘；叶鞘偏鼓状，纸质，松松抱茎，鞘口斜截。

总状花序1-5个，直立，顶生或侧生于当年生的茎上部，不高出叶外，通常长1-2厘米，具3-6朵小花；花苞片卵状披针形，长2-3毫米，宽约1毫米，先端急尖，具1条脉；花梗和子房长4毫米；花白色，开展；中萼片卵状长圆形，长约4毫米，宽1.8毫米，先端急尖，具3条脉；侧萼片斜三角状披针形，长4毫米，基部歪斜，宽达3.5毫米，先端急尖，具3-4条脉；萼囊圆锥形。

花瓣近圆形，长4毫米，宽1.7毫米，先端急尖，边缘微波状；唇瓣浅绿色，近圆形，长5毫米，宽约4毫米，不明显3裂；侧裂片半圆形，中部以上边缘具细齿；中裂片宽卵状三角形，先端短尖，边缘鸡冠状皱褶；唇盘具2-3条褶片连成一体的肉脊，其先端稍收窄；蕊柱长约2毫米，上端扩大；药帽短圆锥形，前端边缘微缺刻。

蒴果卵球形，粗约5毫米，具3个棱。花期9-10月。