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本种与笄石菖Juncus prismatocarpus R. Br.相近，但本种植株较矮小，叶圆筒形，具完全横隔，叶耳大，长1.4-1.7毫米，头状花序较少，每个头状花序通常仅有3-5朵花，花被片较小，长约3毫米，蒴果三棱状长卵形，长3-3.5毫米，易于区别。
又本种与针灯心草J. wallichianus Laharpe的区别在于植株较小，叶耳大，头状花序少，花被片稍长而尖锐，近相等，花柱极短，柱头细长，蒴果上部渐狭至顶端具短尖头 。
