我国海域海草种类丰富，生物多样性高。海南岛东海岸监控区分布的海草具有典型的热带特点，热带种与亚热带种均有分布，主要海草种类有8种，优势种类为泰莱草和海菖蒲。部分海域海草成床分布。

高隆湾 海草呈点片状结合分布，大部分海域的海草分布呈点状分布，少部分为片状分布。海草种类有泰莱草和海菖蒲。海草平均密度为161株/m2，平均盖度为45.7%。海草伴生生物在调查断面上很少，仅11种，该海域海草床共调查到8种鱼类以及一些馒头蟹科和梭子蟹科蟹类。

龙湾港 湾内开阔，生长有大片的海草，向南与潭门港岸线海草床基本连成一片，海草种类有泰莱草和海菖蒲。海草平均密度248株/m2，平均盖度为74.85%。该海域沿岸海草床共调查到鱼类12种，还调查到馒头蟹科和梭子蟹科蟹类。伴生生物有17种。

新村港 该港的海草分布，南部海域以大片分布为主，东部海域以点状分布。海草种类有泰莱草、海菖蒲、海神草、羽叶二药藻和小喜盐藻。海草平均密度547株/m2，平均盖度为65.5%。共调查到鱼类8种。伴生生物有21种。

黎安港 该海域的生物资源非常丰富，海草面积约有1.0km2，海草基本以大面积分布，偶有小面积分布。海草种类有泰莱草、海菖蒲、海神草和针叶藻。海草平均密度为254株/m2，平均盖度为57.8%。该港海草床底栖生物丰富，常见的类群有紫海绵、梭子蟹、网新锚参、细鳞刺等。伴生生物有25种。

长圮港 海草分布一般以混合方式生长，也有单种小面积分布。海草种类有泰莱草、海菖蒲、喜盐藻、二药藻和针叶藻。海草平均密度291株/m2，平均盖度为54.6%。该海域沿岸海草床共调查到鱼类8种，及大量的馒头蟹科和梭子蟹科的蟹类。伴生生物有17种。

海南东部的文昌、琼海和陵水沿岸海域，有大片海草床分布，监控区长圮港与琼海岸线南端的龙湾港、潭门港和地处文昌岸线北端的高隆湾海草床连成了海南东部沿岸大片海草资源。与珊瑚礁生态相比，海草床生态系统相对较稳健，但海洋资源开发、高密度养殖会给海草生存带来很大的压力，特别是像炸鱼等破坏性作业行为，更会使海草资源遭到破坏。