三维荧光光谱图的表示方式有两种，即三维投影图和等高线荧光光谱图。
三维荧光光谱收集了试样的总荧光数据，它是一系列的荧光激发光谱和发射光谱的汇集。由计算机收集扫描数据，通常以发射波长作为x轴，激发波长作为y轴，荧光强度作为z轴而构成三维投影图.作图时y轴的激发波长可以由小到大，所得的为正面图，也可以由大到小，所得的为背面图。
人血浆在pH为7.40(磷酸盐缓冲溶液)水溶液中，于23℃温度下记录的总荧光三维投影正面图。此体系的最强荧光峰在紫外光区，而在可见光域的荧光强度则低的很多。
在计算机收集总荧光扫描数据之后，用计算机的某种程序或用三维自动绘图仪，以发射波长为x轴，激发波长为夕轴，把荧光强度相等的点用线连接来起，则在平面上形成等高线图，称为等高线荧光光谱图。
